Co-IP + LC-MS

 鑒于蛋白質(zhì)相互作用的多樣性、動態(tài)性，因此，將免疫沉淀技術(shù)（Co-IP）和LC-MS有機(jī)結(jié)合，高通量、系統(tǒng)性的解析特定蛋白質(zhì)的相互作用網(wǎng)絡(luò)，具有顯著的技術(shù)優(yōu)勢，體現(xiàn)在：（1）能真正從系統(tǒng)學(xué)層面上解析蛋白質(zhì)相互作用的復(fù)雜、動態(tài)網(wǎng)絡(luò)。免疫沉淀復(fù)合物通過LC-MS鑒定，至少能鑒定到幾百個蛋白質(zhì)，排除一些非特異性的相互作用，至少能篩選出幾十到上百個潛在的、與目的蛋白相互作用分子。非常有利于系統(tǒng)理解特定蛋白質(zhì)及其相互作用網(wǎng)絡(luò)與細(xì)胞生理功能的關(guān)系；有助于快速鎖定相互作用目標(biāo)分子。通過LC-MS的鑒定結(jié)果，能一目了然的明晰樣品到底有哪些蛋白質(zhì)，看到了，就能更好的去選擇和驗(yàn)證，方向更為明確，實(shí)驗(yàn)成功率顯著提高；研究方向和目標(biāo)更具系統(tǒng)性。因?yàn)橥ㄟ^一次LC-MS實(shí)驗(yàn)，至少能鑒定幾十個潛在的、與目的蛋白相互作用的分子，建立屬于自己的、獨(dú)有的相互作用數(shù)據(jù)庫。分別對這些潛在的相互作用進(jìn)行深入的生物學(xué)功能實(shí)驗(yàn)分析，能發(fā)表一系列連續(xù)的學(xué)術(shù)文章，使研究者的成果更為系統(tǒng)。

 ITRAQ/TMT

 ITRAQ/TMT技術(shù)是一種新的、功能強(qiáng)大的可同時對四種樣品進(jìn)行絕對和相對定量研究的方法。在串聯(lián)質(zhì)譜中，信號離子表現(xiàn)為不同質(zhì)荷比（114~117）的峰，因此，根據(jù)波峰的高度及面積，可以得到蛋白質(zhì)的定量信息。雖然DIGE和ICAT已經(jīng)廣泛應(yīng)用于蛋白質(zhì)研究，但是ITRAQ/TMT作為一種新的蛋白質(zhì)絕對和相對定量技術(shù)，具有很好的精確性和重復(fù)性，并且彌補(bǔ)了DIGE及ICAT的不足。同時，該技術(shù)結(jié)合非凝膠串聯(lián)質(zhì)譜技術(shù)，對復(fù)雜樣本、細(xì)胞器、細(xì)胞裂解液等樣本進(jìn)行相對定量研究。尋找差異表達(dá)蛋白，并分析蛋白功能。

 DIGE-2D

采用雙向電泳DIGE熒光差異蛋白表達(dá)分析系統(tǒng)，對不同類型，不同個體細(xì)胞、組織、或經(jīng)過不同處理和不同生長條件下的蛋白質(zhì)表達(dá)差異的分析，以研究疾病的分子機(jī)理、分子診斷、藥物作用機(jī)理等。